Projets de la Chaire de recherche de biosécurité en production laitière
Les activités de la Chaire de recherche de biosécurité en production laitière s’articulent sous trois thèmes de recherche
Validation des stratégies de diagnostic rapides, robustes et efficaces pour soutenir la mise en œuvre de programmes de biosécurité rigoureux.
THÈME 2
Développement de programmes et d'outils de surveillance et contrôle des maladies efficaces et économiquement viables.
THÈME 3
Identification des pratiques clés de biosécurité pour prévenir l'introduction ou la propagation des maladies entre les troupeaux (biosécurité externe ou bio-exclusion) et pour contrôler la prévalence intra-troupeau.
THÈME 1
Le BVD est une maladie infectieuse endémique, souvent sous-diagnostiquée et qui menace la rentabilité et la durabilité des fermes laitières. Cette maladie a un impact important sur le bien-être des animaux et sur l’utilisation d’antimicrobiens et l’innocuité des aliments.
Par conséquent, il est crucial de mettre en œuvre des plans de biosécurité fondés sur des preuves scientifiques solides.
Le virus de la diarrhée virale bovine - BVD
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Décrire la prévalence d'infection au BVD et identifier les pratiques associées à la probabilité d'infection d'un troupeau.
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Évaluer les performances diagnostiques de différentes approches pour déterminer le statut d'un troupeau vis-à-vis du BVD.
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Établir les bases et évaluer différentes approches de contrôle du BVD.
Marie-Pascale Morin
Étudiante au PhD
Simon Dufour
Professeur
Jean-Philippe Roy
Professeur
Gilles Fecteau
Professeur
Surveillance de la diarrhée virale bovine
dans les troupeaux laitiers canadiens
ÉQUIPE
Pour ce faire
Objectif
Développer un programme de surveillance et contrôle du BVD pour le bénéfice des bovins, des producteurs laitiers et des consommateurs.
Résultats
Les résultats de la recherche seront essentiels à l’élaboration de meilleurs programmes de prévention de la transmission de la maladie. Les producteurs(rices) laitiers, les médecins vétérinaires et les gouvernements disposeront de nouveaux outils de travail pour la lutte et, dans certains cas, l’éradication d’autres maladies infectieuses.
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Décrire les mesures de biosécurité en place
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Explorer la mise en place des recommandations suggérées par les médecins vétérinaires référents
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Identifier les motivations et difficultés des producteurs pour la mise en place des pratiques de biosécurité.
Vitoria Lima Campêlo
Étudiante au PhD
Simon Dufour
Professeur
Cécile Aenishaenslin
Professeure
Manon Racicot
Professeure
Méthodologie pour évaluer l’adoption des pratiques de biosécurité dans les fermes laitières canadiennes et identification des obstacles à leur mise en œuvre
ÉQUIPE
Pour ce faire
Objectif
Évaluer l’adoption des pratiques de biosécurité et identification des obstacles à leur mise en œuvre dans les fermes laitières canadiennes.
Résultats
Les résultats de la recherche permettront de comprendre les causes et les difficultés auxquelles ils peuvent être confrontés et qui empêchent une meilleure mise en œuvre des pratiques de biosécurité et de proposer des stratégies pour surmonter certaines de ces difficultés et augmenter la biosécurité dans les fermes laitières canadiennes.
Les mesures de biosécurité
Les mesures de biosécurité appliquées en production animale peuvent limiter la transmission et la propagation des maladies infectieuses, apportant une série d’avantages, tels que la réduction de l’utilisation des antibiotiques, une meilleure qualité du lait et le bien-être des animaux.
Malgré les avantages, on ne comprend pas pourquoi l’utilisation des mesures de biosécurité est apparemment faible dans les exploitations laitières au Canada, compte tenu des dangers d’introduction de maladies.
Résultats
Les résultats permettront d’apporter une nouvelle vision sur les pratiques de biosécurité mises en place dans les élevages. Ils permettront d’adopter une approche ciblée dans la lutte contre les maladies selon les différents profils de ferme mis en évidence. Enfin cela permettra d’adopter une démarche préventive envers les élevages considérés comme à risque.
ÉQUIPE
Pour ce faire
Objectif
À partir des profils de biosécurité des fermes laitières canadiennes, de caractériser les fermes laitières et déterminer leurs statuts par rapport aux différentes maladies.
La biosécurité
La biosécurité correspond à l’ensemble des pratiques permettant de limiter l’introduction et la propagation d’agent pathogène dans un élevage.
L’information sur les mesures de biosécurité est principalement collectée à l’aide de questionnaires d’évaluation du risque. Ces questionnaires permettent potentiellement de prédire le statut infectieux du troupeau mais leur analyse est complexe en raison du nombre élevé de variables.
L’apprentissage machine s’avère donc une alternative intéressante pour aborder les données provenant des questionnaires de biosécurité.
Développement et validation de modèles de classification pour déterminer le statut des troupeaux laitiers aux maladies infectieuses hautement prioritaires de l’industrie laitière canadienne
Faustin Farison
Étudiant au PhD
Juan Carlos Arango Sabogal
Professeur
Simon Dufour
Professeur
Pablo Valdes Donoso
Professeur
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Décrire les combinaisons des pratiques de biosécurité qui sont plus fréquemment mises en place dans les fermes à l’aide d’algorithmes de règles d’association
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Classer les troupeaux en fonction de leurs profils de biosécurité
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Développer et valider des algorithmes de classification permettant de prédire le statut des troupeaux vis-à-vis des maladies.
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Réaliser une analyse coût-bénéfice des profils de biosécurité
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Valider un test ELISA (lait de réservoir) pour déterminer la prévalence intra-troupeau de la leucose
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Estimer la prévalence intra-troupeau de la leucose au Canada
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Déterminer l’association entre les pratiques de biosécurité et la prévalence intra-troupeau de la leucose au Québec
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Comparer la prévalence intra-troupeau observée en 2022 avec celle rapportée en 2018 au Québec.
Karol Gilberto Solano Suarez
Étudiant au PhD
Simon Dufour
Professeur
Jean-Philippe Roy
Professeur
Juan Carlos Arango Sabogal
Professeur
Développement d'un programme de surveillance et contrôle de la leucose bovine dans les troupeaux laitiers canadiens
ÉQUIPE
Pour ce faire
Objectif
Développer un programme de surveillance et de contrôle de la leucose bovine au Canada.
Résultats
Les résultats de la recherche permettront de proposer de meilleures pratiques de gestion et de proposer un programme de surveillance et de contrôle de la maladie. Les producteurs laitiers, les médecins vétérinaires et les gouvernements disposeront de nouveaux outils de travail pour lutter contre la leucose bovine et, dans certains cas, l’éradication d’autres maladies infectieuses.
Le virus de la leucémie bovine
VLB
Le VLB affecte la santé et la production des bovins laitiers. Les troupeaux VLB-positifs rencontrent des freins pour le commerce international avec les pays où la maladie est éradiquée. La prévalence de la maladie est directement associée à la biosécurité.
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Estimer la prévalence de MAP et les facteurs de risques associés dans les troupeaux laitiers canadiens.
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Déterminer la performance diagnostique (sensibilité et spécificité) de la culture bactérienne et de la PCR réalisées sur des échantillons environnementaux ainsi que de l’ELISA sur le lait de réservoir pour détecter les troupeaux atteints par MAP.
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Proposer des stratégies pour le dépistage de MAP dans des troupeaux laitiers qui soient performantes, économiquement soutenables, facilement applicables et en accord avec les objectifs des parties prenantes.
William Lelorel Nankam Nguekap
Étudiant au PhD
Juan Carlos Arango Sabogal
Professeur
Jean-Philippe Roy
Professeur
Nathalie Bissonnette
Professeure
Prévalence et évaluation des stratégies de dépistage de Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) dans les troupeaux laitiers canadiens
ÉQUIPE
Pour ce faire
Objectif
Proposer des stratégies performantes avec un bon rapport coût-efficacité et en accord avec les objectifs des parties prenantes (producteurs, vétérinaires, gouvernement) pour le dépistage de MAP dans les troupeaux laitiers.
Résultats
Les résultats de mon projet de recherche permettront la comparaison de la prévalence de MAP au fil du temps et dans la même région; l’estimation et la comparaison de la performance diagnostique des tests dans une même population et qui reflète la population cible; et l’identification des échantillons environnementaux les plus précis et ayant le meilleur rapport coût-efficacité pour le dépistage de MAP. Toutes des lacunes dans les connaissances qui entravent le succès des programmes de prévention et de contrôle de MAP dans le monde et qui ont été identifiées par les experts.
Les parties prenantes auront à leur disposition des stratégies pour la détection des troupeaux atteints par MAP en accord avec leurs objectifs qui pourront être adoptées dans les programmes de prévention et de contrôle de la paratuberculose.
MAP
Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis (MAP) est l’agent causal de la paratuberculose, une maladie infectieuse, chronique, incurable des ruminants, caractérisée par une entérite granulomateuse.
MAP cause des pertes économiques importantes au sein des troupeaux laitiers et est associée à la maladie de Crohn chez l'humain. Certes, la causalité n’est pas démontrée, cette association inquiète, car MAP a été isolé des produits destinés à la consommation des humains tels que la viande, le lait cru et pasteurisé.
L’évaluation et l’amélioration des mesures de biosécurité visant à prévenir l’introduction et la dissémination de MAP au sein et entre les troupeaux, nécessité des stratégies de dépistage avec de bons rapports coût-efficacité.
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Évaluer prévalence actuelle de S. Dublin
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Estimer la précision d'un test anticorps (ELISA) pour déterminer le statut d’un troupeau avec : 1 réservoir, le sang de 10 animaux, des échantillons de l'environnement
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Examiner différentes stratégies diagnostiques (≥2 réservoirs, 20 animaux, combinaison) et estimer leurs coûts
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Ordonner des stratégies et proposer celles optimales grâce à l'outil d'Aide à la Décision multicritères
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Identifier les facteurs de risque pour S. Dublin
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Rechercher la présence de "clusters" géographiques.
Maryse Um
Chercheuse postdoctorale
Simon Dufour
Professeur
André Ravel
Professeur
Validation des stratégies d’échantillonnage du lait de réservoir et étude des facteurs de risques de Salmonella Dublin dans les troupeaux laitiers
ÉQUIPE
Pour ce faire
Objectif
Valider des stratégies d'échantillonnage du lait de réservoir et d'identifier les facteurs de risque de S. Dublin dans les fermes laitières au Québec.
Résultats
Les résultats de la recherche permettront d'orienter les producteurs(rices) laitiers et leurs vétérinaires dans le choix d’un scénario de testage du lait de réservoir et d’autres types d’échantillons/analyses pour prédire le statut de leur troupeau.
De plus, l'industrie disposera de recommandations précises de biosécurité pour prévenir l'introduction dans les troupeaux négatifs et des stratégies de mitigation pour contrôler la prévalence intratroupeau.
Enfin, les gouvernements disposeront de nouveaux outils de lutte contre Salmonella Dublin.
Salmonella Dublin
Salmonella Dublin est une entérobactérie zoonotique apparue chez les bovins laitiers au Québec en 2011. Le sérotype Dublin est adapté aux bovins, ce qui entraîne la présence d'animaux porteurs asymptomatiques qui vont contaminer et entretenir la circulation de la bactérie dans les troupeaux. Le lait de réservoir semble bien pratique pour diagnostiquer la maladie. Cependant, la méthode de diagnostic optimale pour prédire le statut d’un troupeau reste à préciser.
De plus, la biosécurité semble jouer un rôle important dans l'introduction de S. Dublin. Par conséquent, le lien entre les statuts des troupeaux et leurs pratiques de biosécurité doit être investigué.
